Homo sapiens Gene: USH1C | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-34081.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | USH1C | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | AIE-75; DFNB18; DFNB18A; NY-CO-37; NY-CO-38; PDZ-45; PDZ-73; PDZ-73/NY-CO-38; PDZ73; PDZD7C; ush1cpst | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000006611 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe)
Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe)
Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe)
Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe)
Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe)
Usher syndrome 1C (autosomal recessive, severe)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a scaffold protein that functions in the assembly of Usher protein complexes. The protein contains PDZ domains, a coiled-coil region with a bipartite nuclear localization signal and a PEST degradation sequence. Defects in this gene are the cause of Usher syndrome type 1C and non-syndromic sensorineural deafness autosomal recessive type 18. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:17493895-17544416 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p15.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 14 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 6 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9Y6N9 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10083 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.502072 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001297764 NM_005709 NM_153676 XM_005252725 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12597 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605242 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31438 CCDS73265 CCDS7825 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 09241 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB006955 AB018687 AC124799 AF039699 AF039700 AK290788 BC016057 BK000147 CH471064 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC18048 AAC18049 AAH16057 BAA81739 BAA81740 BAF83477 DAA00086 EAW68432 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10083 | ||||||||||||||||||||||