Homo sapiens Gene: OTOF | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-35725.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | OTOF | ||||||||||||||||||
Gene Name | otoferlin | ||||||||||||||||||
Synonyms | AUNB1; DFNB6; DFNB9; FER1L2; NSRD9 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000115155 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
otoferlin
otoferlin
otoferlin
otoferlin
otoferlin
otoferlin
|
||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Mutations in this gene are a cause of neurosensory nonsyndromic recessive deafness, DFNB9. The short form of the encoded protein has 3 C2 domains, a single carboxy-terminal transmembrane domain found also in the C. elegans spermatogenesis factor FER-1 and human dysferlin, while the long form has 6 C2 domains. The homology suggests that this protein may be involved in vesicle membrane fusion. Several transcript variants encoding multiple isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:26457203-26558698 | ||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
Band | p23.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | Q9HC10 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 9381 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.91608 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001287489 NM_004802 NM_194248 NM_194322 NM_194323 XM_005264644 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8515 | ||||||||||||||||||
OMIM | 603681 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1724 CCDS1725 CCDS1726 CCDS46241 CCDS74497 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC093378 AC108070 AF107403 AF183185 AF183186 AF183187 AK296272 CH471053 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAD26117 AAG12991 AAG12992 AAG17468 AAY15083 BAG58982 EAX00684 EAX00686 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 9381 | ||||||||||||||||||