Homo sapiens Gene: RPL23A | |||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37482.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPL23A | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein L23a | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | L23A; MDA20 | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000198242 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosomal protein L23a
ribosomal protein L23a
ribosomal protein L23a
|
||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 60S subunit. The protein belongs to the L23P family of ribosomal proteins. It is located in the cytoplasm. The protein may be one of the target molecules involved in mediating growth inhibition by interferon. In yeast, the corresponding protein binds to a specific site on the 26S rRNA. This gene is co-transcribed with the U42A, U42B, U101A, and U101B small nucleolar RNA genes, which are located in its third, first, second, and fourth introns, respectively. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, there are multiple processed pseudogenes of this gene dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 17:28719393-28724359 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 153 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Peptide chain elongation pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Viral mRNA Translation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
Influenza Infection pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Influenza Life Cycle pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ribosome pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7EMA7 K7ERT8 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6147 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.635897 Hs.719501 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000984 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10317 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 602326 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS11241 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 15998 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC010761 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 26809 6147 | ||||||||||||||||||||||||||||