Homo sapiens Gene: ITGA5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-37894.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ITGA5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CD49e; FNRA; VLA5A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000161638 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide)
integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide)
integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide)
integrin, alpha 5 (fibronectin receptor, alpha polypeptide)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The product of this gene belongs to the integrin alpha chain family. Integrins are heterodimeric integral membrane proteins composed of an alpha chain and a beta chain. This gene encodes the integrin alpha 5 chain. Alpha chain 5 undergoes post-translational cleavage in the extracellular domain to yield disulfide-linked light and heavy chains that join with beta 1 to form a fibronectin receptor. In addition to adhesion, integrins are known to participate in cell-surface mediated signalling. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:54395261-54419460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 43 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 8 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Elastic fibre formation pathway
Fibronectin matrix formation pathway
Signal transduction by L1 pathway
L1CAM interactions pathway
Developmental Biology pathway
Extracellular matrix organization pathway
Axon guidance pathway
Hemostasis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
Hematopoietic cell lineage pathway
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Bacterial invasion of epithelial cells pathway
Shigellosis pathway
Phagosome pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
Integrin signaling pathway pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrin family cell surface interactions
VEGFR3 signaling in lymphatic endothelium
Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling
Signaling events mediated by focal adhesion kinase
Angiopoietin receptor Tie2-mediated signaling
Syndecan-4-mediated signaling events
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.505654 Hs.691136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002205 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8880 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00627 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||