Homo sapiens Gene: SEMA6A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-38142.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEMA6A | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000092421 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
sema domain, transmembrane domain (TM), and cytoplasmic domain, (semaphorin) 6A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The transmembrane semaphorin SEMA6A is expressed in developing neural tissue and is required for proper development of the thalamocortical projection (Leighton et al., 2001 [PubMed 11242070]).[supplied by OMIM, Feb 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:116443616-116574934 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q23.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Other semaphorin interactions pathway
Developmental Biology pathway
Semaphorin interactions pathway
Axon guidance pathway
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KEGG |
Axon guidance pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9H2E6 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | D6RAG9 D6RCR0 Q96SW4 Q96SY4 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57556 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.156967 Hs.624096 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_020796 NM_001300780 XM_005272041 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:10738 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605885 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS47256 CCDS75288 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06906 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AB037789 AC008524 AC010296 AC027304 AF279656 AK027471 AK027501 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAG29378 BAA92606 BAB55136 BAB55158 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 57556 | ||||||||||||||||||||||