Homo sapiens Gene: LSM6 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40113.5 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | LSM6 | ||||||||||||||||||
Gene Name | LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||
Synonyms | YDR378C | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000164167 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
LSM6 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
Sm-like proteins were identified in a variety of organisms based on sequence homology with the Sm protein family (see SNRPD2; MIM 601061). Sm-like proteins contain the Sm sequence motif, which consists of 2 regions separated by a linker of variable length that folds as a loop. The Sm-like proteins are thought to form a stable heteromer present in tri-snRNP particles, which are important for pre-mRNA splicing.[supplied by OMIM, Apr 2004] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 4:146175685-146200000 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q31.22 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 38 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA decay by 5' to 3' exoribonuclease pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | P62312 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 11157 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.190520 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_007080 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17017 | ||||||||||||||||||
OMIM | 607286 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3767 | ||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AC097372 AF182292 AJ238098 AK312126 BC016026 CH471056 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAD56230 AAH16026 AAY41032 BAG35062 CAB45869 EAX05029 EAX05030 EAX05031 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 11157 | ||||||||||||||||||