Homo sapiens Gene: PRKDC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-408612.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRKDC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | DNA-PKcs; DNAPK; DNPK1; HYRC; HYRC1; IMD26; p350; XRCC7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000253729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide
protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide
protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide
protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Vaccinia virus protein C16 influences the immune response by binding to the XRCC6/XRCC5 (Ku70/80) complex thus blocking PRKDC-dependent DNA sensing in fibroblast.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes the catalytic subunit of the DNA-dependent protein kinase (DNA-PK). It functions with the Ku70/Ku80 heterodimer protein in DNA double strand break repair and recombination. The protein encoded is a member of the PI3/PI4-kinase family.[provided by RefSeq, Jul 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:47773108-47960183 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q11.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 298 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
Cell cycle pathway
Non-homologous end-joining pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Class I PI3K signaling events mediated by Akt
Coregulation of Androgen receptor activity
BARD1 signaling events
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P78527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E7EUY0 F5GX40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.491682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001081640 NM_006904 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:9413 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 600899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS75734 CCDS75735 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB052953 AB208860 AC021236 AC103686 AY030284 AY316117 L27425 U34994 U35835 U47077 U63630 U90415 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA79184 AAA79244 AAB39925 AAB51722 AAC50210 AAC52019 AAK40350 AAP69525 BAB79635 BAD92097 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||