Homo sapiens Gene: VPS28 | |||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-40909.6 | ||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||
Gene Symbol | VPS28 | ||||||||||||||||||||
Gene Name | vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000160948 | ||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
vacuolar protein sorting 28 homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein involved in endosomal sorting of cell surface receptors via a multivesicular body/late endosome pathway. The encoded protein is one of the three subunits of the ESCRT-I complex (endosomal complexes required for transport) involved in the sorting of ubiquitinated proteins. The two other subunits of ESCRT-I are vesicular protein sorting 23, also known as tumor susceptibility gene 101 (TSG101), and vesicular protein sorting 37. Two alternative transcripts encoding different isoforms have been described. Additional alternative transcripts may exist but the proteins encoded by these transcripts have not been verified experimentally. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 8:144423601-144428563 | ||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||
Band | q24.3 | ||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 24 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||
REACTOME |
Membrane binding and targetting of GAG proteins pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Endosomal Sorting Complex Required For Transport (ESCRT) pathway
Synthesis And Processing Of GAG, GAGPOL Polyproteins pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Assembly Of The HIV Virion pathway
Budding and maturation of HIV virion pathway
Disease pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Endocytosis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9UK41 | ||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PI55 E9PLM9 E9PQR7 E9PR04 Q548N1 | ||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 51160 | ||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.418175 | ||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_016208 NM_183057 XM_005272324 | ||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:18178 | ||||||||||||||||||||
OMIM | 611952 | ||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6425 CCDS34967 | ||||||||||||||||||||
HPRD | 11675 | ||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||
EMBL | AF182844 AF205589 AF316887 BC006485 BC019321 BC050713 CH471162 | ||||||||||||||||||||
GenPept | AAF00499 AAH06485 AAH19321 AAH50713 AAK00314 EAW82094 EAW82100 | ||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 51160 | ||||||||||||||||||||