Homo sapiens Gene: ABCG1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4231.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ABCG1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ABC8; WHITE1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000160179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
ATP-binding cassette, sub-family G (WHITE), member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
ABCG1 regulates innate immunity in a tissue-selective manner and Abcg1(-/-) mice have an enhanced pulmonary host defence response driven predominantly by hematopoietic cells.
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Abcg1 regulates innate immunity in a tissue-selective manner and Abcg1(-/-) mice have an enhanced pulmonary host defense response driven predominantly by hematopoietic cells.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the superfamily of ATP-binding cassette (ABC) transporters. ABC proteins transport various molecules across extra- and intra-cellular membranes. ABC genes are divided into seven distinct subfamilies (ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20, White). This protein is a member of the White subfamily. It is involved in macrophage cholesterol and phospholipids transport, and may regulate cellular lipid homeostasis in other cell types. Six alternative splice variants have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 21:42199689-42297244 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
ABCA transporters in lipid homeostasis pathway
ABC-family proteins mediated transport pathway
HDL-mediated lipid transport pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Metabolism pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
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KEGG |
ABC transporters pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.124649 Hs.670265 Hs.714136 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004915 NM_016818 NM_207174 NM_207627 NM_207628 NM_207629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13681 CCDS13682 CCDS13683 CCDS42937 CCDS42938 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04355 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||