Homo sapiens Gene: KARS | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-42717.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KARS | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysyl-tRNA synthetase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CMTRIB; DFNB89; KARS1; KARS2; KRS | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000065427 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysyl-tRNA synthetase
lysyl-tRNA synthetase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Aminoacyl-tRNA synthetases are a class of enzymes that charge tRNAs with their cognate amino acids. Lysyl-tRNA synthetase is a homodimer localized to the cytoplasm which belongs to the class II family of tRNA synthetases. It has been shown to be a target of autoantibodies in the human autoimmune diseases, polymyositis or dermatomyositis. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 16:75627474-75648643 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q23.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 77 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Mitochondrial tRNA aminoacylation pathway
Cytosolic tRNA aminoacylation pathway
tRNA Aminoacylation pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Aminoacyl-tRNA biosynthesis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.3100 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001130089 NM_005548 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS10923 CCDS45532 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03249 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||