Homo sapiens Gene: SMTN | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4376.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SMTN | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | smoothelin | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000183963 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
smoothelin
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a structural protein that is found exclusively in contractile smooth muscle cells. It associates with stress fibers and constitutes part of the cytoskeleton. This gene is localized to chromosome 22q12.3, distal to the TUPLE1 locus and outside the DiGeorge syndrome deletion. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants encoding distinct isoforms. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:31064105-31104757 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q12.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.738578 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001207017 NM_001207018 NM_006932 NM_134269 NM_134270 XM_006724298 XM_006724303 XM_006724306 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13886 CCDS13887 CCDS13888 CCDS74845 CCDS74846 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03675 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||