Homo sapiens Gene: SNX6 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-4564.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNX6 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | sorting nexin 6 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000129515 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
sorting nexin 6
sorting nexin 6
sorting nexin 6
sorting nexin 6
sorting nexin 6
sorting nexin 6
sorting nexin 6
sorting nexin 6
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the sorting nexin family. Members of this family contain a phox (PX) domain, which is a phosphoinositide binding domain, and are involved in intracellular trafficking. This protein associates with the long isoform of the leptin receptor, the transforming growth factor-beta family of receptor serine-threonine kinases, and with receptor tyrosine kinases for platelet-derived growth factor, insulin, and epidermal growth factor. This protein may form oligomeric complexes with family member proteins through interactions of both the PX domain and the coiled coil regions of the molecules. Translocation of this protein from the cytoplasm to the nucleus occurs after binding to proviral integration site 1 protein. This gene results in two transcripts encoding two distinct isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:34561094-34630183 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 50 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TGF_beta_Receptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.276523 Hs.356647 Hs.629592 Hs.720717 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021249 NM_152233 XM_006720224 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41942 CCDS9648 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12086 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||