Homo sapiens Gene: CLP1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-46990.7 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLP1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cleavage and polyadenylation factor I subunit 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | hClp1; HEAB | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000172409 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)
CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)
CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)
CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)
CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)
CLP1, cleavage and polyadenylation factor I subunit, homolog (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a member of the Clp1 family. The encoded protein is a multifunctional kinase which is a component of the tRNA splicing endonuclease complex and a component of the pre-mRNA cleavage complex II. This protein is implicated in tRNA, mRNA, and siRNA maturation. Mutations in this gene are associated with pontocerebellar hypoplasia type 10 (PCH10). Alternatively splice transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2014] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:57648992-57661868 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q12.1 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 16 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Processing of Intronless Pre-mRNAs pathway
mRNA 3'-end processing pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Cleavage of Growing Transcript in the Termination Region pathway
RNA Polymerase II Transcription Termination pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
Processing of Capped Intronless Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
mRNA surveillance pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q92989 | ||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | E9PJM4 E9PKV5 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10978 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.523687 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006831 NM_001142597 XM_006718425 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:16999 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 608757 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7964 CCDS44600 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 16382 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AK300232 AK313007 AP000662 BC000446 CH471076 U73524 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC50780 AAH00446 BAG35843 BAG62000 EAW73770 | ||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10978 | ||||||||||||||||||||||||