Homo sapiens Gene: SLC8A1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-47824.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SLC8A1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | NCX1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000183023 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
solute carrier family 8 (sodium/calcium exchanger), member 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
In cardiac myocytes, Ca(2+) concentrations alternate between high levels during contraction and low levels during relaxation. The increase in Ca(2+) concentration during contraction is primarily due to release of Ca(2+) from intracellular stores. However, some Ca(2+) also enters the cell through the sarcolemma (plasma membrane). During relaxation, Ca(2+) is sequestered within the intracellular stores. To prevent overloading of intracellular stores, the Ca(2+) that entered across the sarcolemma must be extruded from the cell. The Na(+)-Ca(2+) exchanger is the primary mechanism by which the Ca(2+) is extruded from the cell during relaxation. In the heart, the exchanger may play a key role in digitalis action. The exchanger is the dominant mechanism in returning the cardiac myocyte to its resting state following excitation.[supplied by OMIM, Apr 2004] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:40097270-40611053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 3 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Reduction of cytosolic Ca++ levels pathway
Platelet homeostasis pathway
Sodium/Calcium exchangers pathway
Transport of inorganic cations/anions and amino acids/oligopeptides pathway
Transmembrane transport of small molecules pathway
Platelet calcium homeostasis pathway
SLC-mediated transmembrane transport pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Calcium signaling pathway pathway
Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) pathway
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) pathway
Cardiac muscle contraction pathway
Dilated cardiomyopathy pathway
Protein digestion and absorption pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.468274 Hs.610508 Hs.624386 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001112800 NM_001112801 NM_001112802 NM_001252624 NM_021097 XM_005264513 XM_005264514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS1806 CCDS46264 CCDS46265 CCDS59430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01659 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||