Homo sapiens Gene: NET1 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-48898.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NET1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | neuroepithelial cell transforming 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ARHGEF8; NET1A | ||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000173848 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
neuroepithelial cell transforming 1
neuroepithelial cell transforming 1
neuroepithelial cell transforming 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is part of the family of Rho guanine nucleotide exchange factors. Members of this family activate Rho proteins by catalyzing the exchange of GDP for GTP. The protein encoded by this gene interacts with RhoA within the cell nucleus and may play a role in repairing DNA damage after ionizing radiation. Pseudogenes of this gene are located on the long arms of chromosomes 1, 7 and 18. Alternative splicing results in multiple transcript variants that encode different protein isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:5412551-5458463 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | p15.1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NRAGE signals death through JNK pathway
G alpha (12/13) signalling events pathway
Rho GTPase cycle pathway
Signalling by NGF pathway
Signaling by Rho GTPases pathway
Signaling by GPCR pathway
p75 NTR receptor-mediated signalling pathway
Signal Transduction pathway
GPCR downstream signaling pathway
Cell death signalling via NRAGE, NRIF and NADE pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of RhoA activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q7Z628 | ||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | B4E1Y1 Q5SQI5 Q5SQI6 Q5SQI7 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10276 | ||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.25155 Hs.713138 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001047160 NM_005863 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14592 | ||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606450 | ||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41483 CCDS7067 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AJ010046 AK299335 AK304028 AK315566 AL732437 BC010285 BC053553 CH471072 S82401 U02081 | ||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAB08847 AAB37683 AAH10285 AAH53553 BAG37941 BAG61338 BAG64943 CAA08974 EAW86445 EAW86446 | ||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10276 | ||||||||||||||||||||||||||||