Homo sapiens Gene: KDM4C | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-49006.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | KDM4C | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | lysine (K)-specific demethylase 4C | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000107077 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
lysine (K)-specific demethylase 4C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the Jumonji domain 2 (JMJD2) family and encodes a protein with one JmjC domain, one JmjN domain, two PHD-type zinc fingers, and two Tudor domains. This nuclear protein functions as a trimethylation-specific demethylase, converting specific trimethylated histone residues to the dimethylated form. Chromosomal aberrations and increased transcriptional expression of this gene are associated with esophageal squamous cell carcinoma. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:6757641-7175648 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p24.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
HDMs demethylate histones pathway
Chromatin organization pathway
Chromatin modifying enzymes pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.709425 Hs.734829 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001146694 NM_001146695 NM_015061 NM_001146696 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS55286 CCDS55287 CCDS6471 CCDS55285 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12016 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||