Homo sapiens Gene: PCNA | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-50801.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PCNA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | proliferating cell nuclear antigen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | ATLD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000132646 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
proliferating cell nuclear antigen
proliferating cell nuclear antigen
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is found in the nucleus and is a cofactor of DNA polymerase delta. The encoded protein acts as a homotrimer and helps increase the processivity of leading strand synthesis during DNA replication. In response to DNA damage, this protein is ubiquitinated and is involved in the RAD6-dependent DNA repair pathway. Two transcript variants encoding the same protein have been found for this gene. Pseudogenes of this gene have been described on chromosome 4 and on the X chromosome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:5114953-5126626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | p12.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 350 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Polymerase switching on the C-strand of the telomere pathway
Removal of the Flap Intermediate from the C-strand pathway
Processive synthesis on the C-strand of the telomere pathway
Telomere C-strand (Lagging Strand) Synthesis pathway
Removal of the Flap Intermediate pathway
Processive synthesis on the lagging strand pathway
Polymerase switching pathway
Leading Strand Synthesis pathway
G0 and Early G1 pathway
G1/S-Specific Transcription pathway
E2F mediated regulation of DNA replication pathway
Repair synthesis for gap-filling by DNA polymerase in TC-NER pathway
Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in TC-NER pathway
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
Repair synthesis of patch ~27-30 bases long by DNA polymerase pathway
Gap-filling DNA repair synthesis and ligation in GG-NER pathway
Removal of DNA patch containing abasic residue pathway
Resolution of AP sites via the multiple-nucleotide patch replacement pathway pathway
DNA Replication pathway
Synthesis of DNA pathway
Resolution of Abasic Sites (AP sites) pathway
Mitotic G1-G1/S phases pathway
S Phase pathway
Chromosome Maintenance pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
Telomere Maintenance pathway
G1/S Transition pathway
Cell Cycle pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH6 (MutSalpha) pathway
Base Excision Repair pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
DNA strand elongation pathway
Mismatch repair (MMR) directed by MSH2:MSH3 (MutSbeta) pathway
Mismatch Repair pathway
Extension of Telomeres pathway
Lagging Strand Synthesis pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
DNA Repair pathway
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KEGG |
DNA replication pathway
Cell cycle pathway
Nucleotide excision repair pathway
Mismatch repair pathway
Base excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Validated nuclear estrogen receptor alpha network
Direct p53 effectors
BARD1 signaling events
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P12004 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5111 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002592 NM_182649 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8729 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 176740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13087 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF527838 AK313286 AL121924 BC000491 BC062439 CH471133 J04718 M15796 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35736 AAA60040 AAH00491 AAH62439 AAM78556 BAG36094 CAC27344 EAX10428 EAX10429 EAX10430 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5111 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||