Homo sapiens Gene: UBE2N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-51220.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | UBE2N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ubiquitin-conjugating enzyme E2N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | HEL-S-71; UBC13; UbcH-ben; UbcH13; UBCHBEN; UBC13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000177889 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ubiquitin-conjugating enzyme E2N
ubiquitin-conjugating enzyme E2N
ubiquitin-conjugating enzyme E2N
ubiquitin-conjugating enzyme E2N
ubiquitin-conjugating enzyme E2N
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
UBE2N abalation resulted in defective B cell development and in impaired B cell and macrophage activation.
TRIM5 requires UBE2W, UBE2N and UBE2V2 enzymatic activities to inhibit retroviral DNA synthesis
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The modification of proteins with ubiquitin is an important cellular mechanism for targeting abnormal or short-lived proteins for degradation. Ubiquitination involves at least three classes of enzymes: ubiquitin-activating enzymes, or E1s, ubiquitin-conjugating enzymes, or E2s, and ubiquitin-protein ligases, or E3s. This gene encodes a member of the E2 ubiquitin-conjugating enzyme family. Studies in mouse suggest that this protein plays a role in DNA postreplication repair. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:93405673-93442262 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 231 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 17 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
IL1 pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
IKK complex recruitment mediated by RIP1 pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
IRAK1 recruits IKK complex pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling pathway
IRAK1 recruits IKK complex upon TLR7/8 or 9 stimulation pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Downstream TCR signaling pathway
ISG15 antiviral mechanism pathway
Interleukin-1 signaling pathway
FCERI mediated NF-kB activation pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
TCR signaling pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Fc epsilon receptor (FCERI) signaling pathway
Interferon Signaling pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Activated TLR4 signalling pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Ubiquitin mediated proteolysis pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH |
CD4 T cell receptor signaling pathway
IL-1 signaling pathway pathway
Toll-like receptor signaling pathway pathway
B cell receptor signaling pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
IL1-mediated signaling events
ATM pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F8VV71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.524630 Hs.610461 Hs.619366 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001012989 NM_003348 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603679 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31875 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04725 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC025260 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 389898 7334 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||