Homo sapiens Gene: SPTBN4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-51618.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SPTBN4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | spectrin, beta, non-erythrocytic 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000160460 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
spectrin, beta, non-erythrocytic 4
spectrin, beta, non-erythrocytic 4
spectrin, beta, non-erythrocytic 4
spectrin, beta, non-erythrocytic 4
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Spectrin is an actin crosslinking and molecular scaffold protein that links the plasma membrane to the actin cytoskeleton, and functions in the determination of cell shape, arrangement of transmembrane proteins, and organization of organelles. It is composed of two antiparallel dimers of alpha- and beta- subunits. This gene is one member of a family of beta-spectrin genes. The encoded protein localizes to the nuclear matrix, PML nuclear bodies, and cytoplasmic vesicles. A highly similar gene in the mouse is required for localization of specific membrane proteins in polarized regions of neurons. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:40466241-40576464 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 25 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interaction between L1 and Ankyrins pathway
L1CAM interactions pathway
NCAM signaling for neurite out-growth pathway
Developmental Biology pathway
Axon guidance pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q9H254 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | Q9UFA1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 57731 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.32706 Hs.595840 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_025213 NM_020971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14896 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606214 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS42569 CCDS12559 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09372 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB046862 AC020929 AF082075 AF311855 AF311856 AL133093 AY004226 AY004227 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAF93171 AAF93172 AAF93173 AAG38874 AAG42473 AAG42474 BAB13468 CAB61407 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 57731 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||