Homo sapiens Gene: SEC23A | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5190.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SEC23A | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | Sec23 homolog A (S. cerevisiae) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CLSD | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100934 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
Sec23 homolog A (S. cerevisiae)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is a member of the SEC23 subfamily of the SEC23/SEC24 family. It is part of a protein complex and found in the ribosome-free transitional face of the endoplasmic reticulum (ER) and associated vesicles. This protein has similarity to yeast Sec23p component of COPII. COPII is the coat protein complex responsible for vesicle budding from the ER. The encoded protein is suggested to play a role in the ER-Golgi protein trafficking. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 14:39031919-39109646 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 72 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen Presentation: Folding, assembly and peptide loading of class I MHC pathway
MHC class II antigen presentation pathway
COPII (Coat Protein 2) Mediated Vesicle Transport pathway
Transport to the Golgi and subsequent modification pathway
Asparagine N-linked glycosylation pathway
Regulation of cholesterol biosynthesis by SREBP (SREBF) pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Post-translational protein modification pathway
ER to Golgi Transport pathway
Metabolism of proteins pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Metabolism pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG |
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.272927 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_006364 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS9668 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06714 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||