Homo sapiens Gene: TCERG1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-52069.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TCERG1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | transcription elongation regulator 1 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CA150; TAF2S; Urn1 | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000113649 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
transcription elongation regulator 1
transcription elongation regulator 1
transcription elongation regulator 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a nuclear protein that regulates transcriptional elongation and pre-mRNA splicing. The encoded protein interacts with the hyperphosphorylated C-terminal domain of RNA polymerase II via multiple FF domains, and with the pre-mRNA splicing factor SF1 via a WW domain. Alternative splicing results in multiple transcripts variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 5:146447311-146511961 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q32 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 101 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | G3V220 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 10915 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.443465 Hs.734605 Hs.735127 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001040006 NM_006706 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15630 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 605409 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4282 CCDS43379 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 10393 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC011375 CH471062 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | EAW61842 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 10915 | ||||||||||||||||||||||