Homo sapiens Gene: SNRPA | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-52147.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPA | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | Mud1; U1-A; U1A | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000077312 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein polypeptide A
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene associates with stem loop II of the U1 small nuclear ribonucleoprotein, which binds the 5' splice site of precursor mRNAs and is required for splicing. The encoded protein autoregulates itself by polyadenylation inhibition of its own pre-mRNA via dimerization and has been implicated in the coupling of splicing and polyadenylation. [provided by RefSeq, Oct 2010] The protein encoded by this gene associates with stem loop II of the U1 small nuclear ribonucleoprotein, which binds the 5\' splice site of precursor mRNAs and is required for splicing. The encoded protein autoregulates itself by polyadenylation inhibition of its own pre-mRNA via dimerization and has been implicated in the coupling of splicing and polyadenylation. [provided by RefSeq, Oct 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:40750637-40765389 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 95 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | M0QXK2 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6626 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.466775 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004596 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11151 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 182285 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12565 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01658 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AC020945 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6626 | ||||||||||||||||||||||