Homo sapiens Gene: PHYH | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-54885.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PHYH | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | phytanoyl-CoA 2-hydroxylase | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | LN1; LNAP1; PAHX; PHYH1; RD | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000107537 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phytanoyl-CoA 2-hydroxylase
phytanoyl-CoA 2-hydroxylase
phytanoyl-CoA 2-hydroxylase
phytanoyl-CoA 2-hydroxylase
phytanoyl-CoA 2-hydroxylase
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the PhyH family and encodes a peroxisomal protein that is involved in the alpha-oxidation of 3-methyl branched fatty acids. Specifically, this protein converts phytanoyl-CoA to 2-hydroxyphytanoyl-CoA. Mutations in this gene have been associated with Refsum disease (RD) and deficient protein activity has been associated with Zellweger syndrome and rhizomelic chondrodysplasia punctata. Alternate transcriptional splice variants, encoding different isoforms, have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:13277796-13302412 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 12 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Alpha-oxidation of phytanate pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Peroxisomal lipid metabolism pathway
Metabolism pathway
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KEGG |
Peroxisome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9IYS5 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 5264 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.498732 Hs.610614 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001037537 NM_006214 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:8940 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 602026 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS41489 CCDS7097 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 03609 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AL138764 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 5264 | ||||||||||||||||||||||