Homo sapiens Gene: CAPN1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-56732.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CAPN1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | calpain 1, (mu/I) large subunit | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | CANP; CANP1; CANPL1; muCANP; muCL | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000014216 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
calpain 1, (mu/I) large subunit
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The calpains, calcium-activated neutral proteases, are nonlysosomal, intracellular cysteine proteases. The mammalian calpains include ubiquitous, stomach-specific, and muscle-specific proteins. The ubiquitous enzymes consist of heterodimers with distinct large, catalytic subunits associated with a common small, regulatory subunit. This gene encodes the large subunit of the ubiquitous enzyme, calpain 1. Several transcript variants encoding two different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2010] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:65180566-65212006 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q13.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 97 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
RANKL pathway
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REACTOME |
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
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KEGG |
Apoptosis pathway
Alzheimer's disease pathway
Protein processing in endoplasmic reticulum pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by PTP1B
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | P07384 | ||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R5A3 E9PIA9 E9PJA6 E9PJJ3 E9PLC9 E9PLX0 E9PMC6 E9PQB3 E9PSA6 | ||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 823 | ||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.502842 Hs.735492 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001198868 NM_001198869 NM_005186 XM_006718698 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:1476 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | 114220 | ||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44644 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 00253 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | AP003068 AY550975 AY796340 BC008751 BC017200 BC075862 CH471076 X04366 | ||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH08751 AAH17200 AAH75862 AAT52221 AAV41878 CAA27881 EAW74367 EAW74370 | ||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 823 | ||||||||||||||||||||||