Homo sapiens Gene: NPHP3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-56896.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NPHP3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | nephronophthisis 3 (adolescent) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000113971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
nephronophthisis 3 (adolescent)
nephronophthisis 3 (adolescent)
nephronophthisis 3 (adolescent)
nephronophthisis 3 (adolescent)
nephronophthisis 3 (adolescent)
nephronophthisis 3 (adolescent)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein containing a coiled-coil (CC) domain, a tubulin-tyrosine ligase (TTL) domain, and a tetratrico peptide repeat (TPR) domain. The encoded protein interacts with nephrocystin, it is required for normal ciliary development, and it functions in renal tubular development. Mutations in this gene are associated with nephronophthisis type 3, and also with renal-hepatic-pancreatic dysplasia, and Meckel syndrome type 7. Naturally occurring read-through transcripts exist between this gene and the downstream ACAD11 (acyl-CoA dehydrogenase family, member 11) gene. [provided by RefSeq, Feb 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:132680609-132722442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 11 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q7Z494 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F2Z3A8 H0YAM4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 27031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.511991 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_153240 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:7907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 608002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3078 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB082531 AC020632 AC055732 AK055253 AK055893 AK094015 AL832863 AL832877 AY257864 AY257865 AY257866 BC068082 CR749498 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAH68082 AAP83423 AAP83424 AAP83425 BAB70891 BAB71038 BAC02709 BAC04268 CAH18321 CAI46200 CAI46202 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 27031 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||