Homo sapiens Gene: APOL1 | |||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-5737.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | APOL1 | ||||||||||||||||||
Gene Name | apolipoprotein L, 1 | ||||||||||||||||||
Synonyms | APO-L; APOL; APOL-I; FSGS4 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000100342 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
apolipoprotein L, 1
|
||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a secreted high density lipoprotein which binds to apolipoprotein A-I. Apolipoprotein A-I is a relatively abundant plasma protein and is the major apoprotein of HDL. It is involved in the formation of most cholesteryl esters in plasma and also promotes efflux of cholesterol from cells. This apolipoprotein L family member may play a role in lipid exchange and transport throughout the body, as well as in reverse cholesterol transport from peripheral cells to the liver. Several different transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2008] |
||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 22:36253010-36267530 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q12.3 | ||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 1 experimentally validated interaction(s) in this database.
|
||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
Scavenging of heme from plasma pathway
Binding and Uptake of Ligands by Scavenger Receptors pathway
|
||||||||||||||||||
KEGG |
African trypanosomiasis pathway
|
||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | O14791 | ||||||||||||||||||
TrEMBL | B1AH96 G8JL88 U5LGU2 | ||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8542 | ||||||||||||||||||
UniGene | Hs.114309 Hs.607747 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_003661 NM_001136540 NM_001136541 NM_145343 XM_005261796 | ||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:618 | ||||||||||||||||||
OMIM | 603743 | ||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13926 CCDS13925 CCDS46702 | ||||||||||||||||||
HPRD | 04774 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | AF019225 AF305224 AF305428 AF323540 AF323543 AF323544 AF323545 AF323546 AF323547 AF323548 AK300454 BC143039 KC339295 Z82215 | ||||||||||||||||||
GenPept | AAB81218 AAG53690 AAI43040 AAK11591 AAK20210 AAL09358 AGX24961 BAG62174 CAI22438 CAQ09089 | ||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8542 | ||||||||||||||||||