Homo sapiens Gene: SNRPD2 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-57903.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNRPD2 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide 16.5kDa | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | Sm-D2; SMD2; SNRPD1 | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000125743 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide 16.5kDa
small nuclear ribonucleoprotein D2 polypeptide 16.5kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the small nuclear ribonucleoprotein core protein family. It is required for pre-mRNA splicing and small nuclear ribonucleoprotein biogenesis. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:45687454-45692569 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q13.32 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 122 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
EGFR1 pathway
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REACTOME |
snRNP Assembly pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
Metabolism of non-coding RNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | K7ERG4 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6633 | ||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.713190 Hs.737619 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_004597 NM_177542 XM_005259180 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11159 | ||||||||||||||||||||||||
OMIM | 601061 | ||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS33053 CCDS54281 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 03038 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC007191 | ||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6633 | ||||||||||||||||||||||||