Homo sapiens Gene: DHX36 | |||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-62011.6 | ||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | DHX36 | ||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36 | ||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000174953 | ||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36
DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36
DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36
DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36
DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36
DEAH (Asp-Glu-Ala-His) box polypeptide 36
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
DHX36 interacts with CpG-A and is associated with IFN-alpha production and IRF7 nuclear translocation upon CpG-A stimulation. DHX36 localizes within the cytosol and directly binds to the TLR domain of MYD88.
DHX36 is a component of a cytosolic viral sensor and is recruited to a complex consisting of DDX1, DDX21 and TICAM1, which triggers type I interferon and cytokine response to dsRNA. (Demonstrated in murine model)
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InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Mus musculus] Dhx36 is a component of a cytosolic viral sensor and is recruited to a complex consisting of Ddx1, Ddx21 and Ticam1, which triggers type I interferon and cytokine response to dsRNA.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the DEAH-box family of RNA-dependent NTPases which are named after the conserved amino acid sequence Asp-Glu-Ala-His in motif II. The protein encoded by this gene has been shown to enhance the deadenylation and decay of mRNAs with 3'-UTR AU-rich elements (ARE-mRNA). The protein has also been shown to resolve into single strands the highly stable tetramolecular DNA configuration (G4) that can form spontaneously in guanine-rich regions of DNA. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 3:154272546-154324497 | ||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||
Band | q25.2 | ||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 37 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
TRAF6 mediated IRF7 activation pathway
RIG-I/MDA5 mediated induction of IFN-alpha/beta pathways pathway
TRAF6 mediated IRF7 activation in TLR7/8 or 9 signaling pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
DEx/H-box helicases activate type I IFN and inflammatory cytokines production pathway
Immune System pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.446270 Hs.599620 | ||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001114397 NM_020865 | ||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS3171 CCDS54657 | ||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 09918 | ||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||