Homo sapiens Gene: CLIP1 | |||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-62398.6 | ||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CLIP1 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | CAP-GLY domain containing linker protein 1 | ||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CLIP; CLIP-170; CLIP170; CYLN1; RSN | ||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000130779 | ||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
CAP-GLY domain containing linker protein 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene links endocytic vesicles to microtubules. This gene is highly expressed in Reed-Sternberg cells of Hodgkin disease. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 12:122271432-122422632 | ||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||
Band | q24.31 | ||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 32 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Resolution of Sister Chromatid Cohesion pathway
Mitotic Prometaphase pathway
Separation of Sister Chromatids pathway
Cell Cycle pathway
M Phase pathway
Mitotic Anaphase pathway
Cell Cycle, Mitotic pathway
Mitotic Metaphase and Anaphase pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
mTOR signaling pathway
Lissencephaly gene (LIS1) in neuronal migration and development
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.524809 Hs.682942 | ||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001247997 NM_002956 NM_198240 XM_005253593 XM_005253594 XM_005253595 XM_006719551 XM_006719552 XM_006719555 | ||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS58285 CCDS9232 CCDS9233 | ||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01568 | ||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||