Homo sapiens Gene: EXOSC3 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-66000.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | EXOSC3 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | exosome component 3 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000107371 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
exosome component 3
exosome component 3
exosome component 3
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a non-catalytic component of the human exosome, a complex with 3'-5' exoribonuclease activity that plays a role in numerous RNA processing and degradation activities. Related pseudogenes of this gene are found on chromosome 19 and 21. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jun 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:37766978-37801437 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p13.2 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 45 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Butyrate Response Factor 1 (BRF1) destabilizes mRNA pathway
Tristetraprolin (TTP) destabilizes mRNA pathway
KSRP destabilizes mRNA pathway
mRNA decay by 3' to 5' exoribonuclease pathway
ATF4 activates genes pathway
PERK regulates gene expression pathway
Unfolded Protein Response (UPR) pathway
Deadenylation-dependent mRNA decay pathway
Metabolism of proteins pathway
Regulation of mRNA stability by proteins that bind AU-rich elements pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
RNA degradation pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.602571 Hs.606213 Hs.712620 Hs.713483 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001002269 NM_016042 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS35016 CCDS43805 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 16220 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||