Homo sapiens Gene: POLR1B | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-66306.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | POLR1B | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000125630 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
polymerase (RNA) I polypeptide B, 128kDa
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
Eukaryotic RNA polymerase I (pol I) is responsible for the transcription of ribosomal RNA (rRNA) genes and production of rRNA, the primary component of ribosomes. Pol I is a multisubunit enzyme composed of 6 to 14 polypeptides, depending on the species. Most of the mass of the pol I complex derives from the 2 largest subunits, Rpa1 and Rpa2 in yeast. POLR1B is homologous to Rpa2 (Seither and Grummt, 1996 [PubMed 8921381]).[supplied by OMIM, Mar 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:112541915-112577150 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q14.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 36 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
TNFalpha pathway
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REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Termination pathway
RNA Polymerase I Chain Elongation pathway
RNA Polymerase I Promoter Escape pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Gene Expression pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Pyrimidine metabolism pathway
Purine metabolism pathway
RNA polymerase pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.619285 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001137604 NM_001282772 NM_001282774 NM_001282776 NM_001282777 NM_001282779 NM_019014 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2097 CCDS46395 CCDS62988 CCDS62989 CCDS62990 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 06852 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||