Homo sapiens Gene: PICALM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-66712.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PICALM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CALM; CLTH; LAP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000073921 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
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phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
phosphatidylinositol binding clathrin assembly protein
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a clathrin assembly protein, which recruits clathrin and adaptor protein complex 2 (AP2) to cell membranes at sites of coated-pit formation and clathrin-vesicle assembly. The protein may be required to determine the amount of membrane to be recycled, possibly by regulating the size of the clathrin cage. The protein is involved in AP2-dependent clathrin-mediated endocytosis at the neuromuscular junction. A chromosomal translocation t(10;11)(p13;q14) leading to the fusion of this gene and the MLLT10 gene is found in acute lymphoblastic leukemia, acute myeloid leukemia and malignant lymphomas. The polymorphisms of this gene are associated with the risk of Alzheimer disease. Multiple alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, May 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:85957684-86069882 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q14.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 30 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Golgi Associated Vesicle Biogenesis pathway
Clathrin derived vesicle budding pathway
trans-Golgi Network Vesicle Budding pathway
Membrane Trafficking pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 8301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.163893 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001008660 NM_001206946 NM_001206947 NM_007166 XM_005274329 XM_005274336 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:15514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 603025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31653 CCDS55783 CCDS55784 CCDS8272 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04320 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 8301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||