Homo sapiens Gene: RPS9 | |||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68296.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RPS9 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ribosomal protein S9 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | S9 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000170889 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
ribosomal protein S9
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Ribosomes, the organelles that catalyze protein synthesis, consist of a small 40S subunit and a large 60S subunit. Together these subunits are composed of 4 RNA species and approximately 80 structurally distinct proteins. This gene encodes a ribosomal protein that is a component of the 40S subunit. The protein belongs to the S4P family of ribosomal proteins. It is located in the cytoplasm. Variable expression of this gene in colorectal cancers compared to adjacent normal tissues has been observed, although no correlation between the level of expression and the severity of the disease has been found. As is typical for genes encoding ribosomal proteins, multiple processed pseudogenes derived from this gene are dispersed through the genome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 19:54200742-54249003 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 130 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) independent of the Exon Junction Complex (EJC) pathway
Nonsense Mediated Decay (NMD) enhanced by the Exon Junction Complex (EJC) pathway
GTP hydrolysis and joining of the 60S ribosomal subunit pathway
Translation initiation complex formation pathway
Activation of the mRNA upon binding of the cap-binding complex and eIFs, and subsequent binding to 43S pathway
Formation of a pool of free 40S subunits pathway
Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex pathway
Ribosomal scanning and start codon recognition pathway
Eukaryotic Translation Termination pathway
Peptide chain elongation pathway
Eukaryotic Translation Elongation pathway
SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane pathway
Viral mRNA Translation pathway
Eukaryotic Translation Initiation pathway
Influenza Infection pathway
Nonsense-Mediated Decay (NMD) pathway
Influenza Viral RNA Transcription and Replication pathway
Translation pathway
Metabolism of proteins pathway
Cap-dependent Translation Initiation pathway
Influenza Life Cycle pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
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KEGG |
Ribosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.546288 | ||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001013 XM_005259135 XM_005277084 XM_005277315 XM_005278287 XM_005278288 XM_006725876 XM_006725964 XM_006726063 XM_006726164 XM_006726201 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS12884 | ||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04696 | ||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||