Version 5.4
| Homo sapiens Gene: HIST1H1D | |||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-68753.6 | ||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
| Gene Symbol | HIST1H1D | ||||||||||||||||||
| Gene Name | histone cluster 1, H1d | ||||||||||||||||||
| Synonyms | H1.3; H1D; H1F3; H1s-2 | ||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000124575 | ||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
histone cluster 1, H1d
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| Protein Structure |
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| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||
| Summary |
Histones are basic nuclear proteins responsible for nucleosome structure of the chromosomal fiber in eukaryotes. Two molecules of each of the four core histones (H2A, H2B, H3, and H4) form an octamer, around which approximately 146 bp of DNA is wrapped in repeating units, called nucleosomes. The linker histone, H1, interacts with linker DNA between nucleosomes and functions in the compaction of chromatin into higher order structures. This gene is intronless and encodes a member of the histone H1 family. Transcripts from this gene lack polyA tails but instead contain a palindromic termination element. This gene is found in the large histone gene cluster on chromosome 6. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 6:26234268-26234933 | ||||||||||||||||||
| Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||
| Band | p22.2 | ||||||||||||||||||
| Transcripts |
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| Interactions | |||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 33 experimentally validated interaction(s) in this database.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||
| No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||
| Pathways | |||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||
| REACTOME |
Activation of DNA fragmentation factor pathway
Apoptotic execution phase pathway
Cellular responses to stress pathway
Apoptosis induced DNA fragmentation pathway
Formation of Senescence-Associated Heterochromatin Foci (SAHF) pathway
Apoptosis pathway
DNA Damage/Telomere Stress Induced Senescence pathway
Cellular Senescence pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||
| SwissProt | P16402 | ||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
| Entrez Gene | 3007 | ||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.136857 | ||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_005320 | ||||||||||||||||||
| HUGO | HGNC:4717 | ||||||||||||||||||
| OMIM | 142210 | ||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS4597 | ||||||||||||||||||
| HPRD | |||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||
| EMBL | AF531303 AK312845 AL031777 BC104874 BC111971 CH471087 M60747 | ||||||||||||||||||
| GenPept | AAA63186 AAI04875 AAI11972 AAN06703 BAG35698 CAB39189 EAW55548 | ||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | 3007 | ||||||||||||||||||