Homo sapiens Gene: ERCC3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-68963.7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ERCC3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | BTF2; GTF2H; RAD25; TFIIH; XPB | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000163161 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)
excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 3 (xeroderma pigmentosum group B complementing)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
ERCC3 is an ATP-dependent DNA helicase that functions in nucleotide excision repair and complements xeroderma pigmentosum group B mutations. It also is the 89 kDa subunit of basal transcription factor 2 (TFIIH) and thus functions in class II transcription. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:127257290-127294176 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q14.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 73 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME |
RNA Polymerase I Transcription Termination pathway
RNA Polymerase I Chain Elongation pathway
RNA Polymerase I Promoter Escape pathway
RNA Polymerase I Transcription Initiation pathway
mRNA Capping pathway
RNA Polymerase II Transcription Pre-Initiation And Promoter Opening pathway
RNA Polymerase II Pre-transcription Events pathway
Formation of RNA Pol II elongation complex pathway
Formation of the Early Elongation Complex pathway
RNA Polymerase II Transcription Elongation pathway
RNA Polymerase II Promoter Escape pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II Transcription Initiation And Promoter Clearance pathway
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE pathway
Formation of HIV elongation complex in the absence of HIV Tat pathway
HIV Transcription Initiation pathway
RNA Polymerase II HIV Promoter Escape pathway
Formation of the HIV-1 Early Elongation Complex pathway
Formation of HIV-1 elongation complex containing HIV-1 Tat pathway
Tat-mediated elongation of the HIV-1 transcript pathway
RNA Pol II CTD phosphorylation and interaction with CE pathway
Transcription of the HIV genome pathway
Late Phase of HIV Life Cycle pathway
Formation of transcription-coupled NER (TC-NER) repair complex pathway
Dual incision reaction in TC-NER pathway
Transcription-coupled NER (TC-NER) pathway
Dual incision reaction in GG-NER pathway
Formation of incision complex in GG-NER pathway
RNA Polymerase I Transcription pathway
Epigenetic regulation of gene expression pathway
RNA Polymerase I Promoter Clearance pathway
NoRC negatively regulates rRNA expression pathway
Global Genomic NER (GG-NER) pathway
HIV Transcription Elongation pathway
RNA Polymerase II Transcription pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
RNA Polymerase I, RNA Polymerase III, and Mitochondrial Transcription pathway
Nucleotide Excision Repair pathway
Gene Expression pathway
Disease pathway
DNA Repair pathway
Negative epigenetic regulation of rRNA expression pathway
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KEGG |
Basal transcription factors pathway
Nucleotide excision repair pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P19447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | F2Z2V4 G3V1S1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_000122 XM_005263618 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:3435 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 133510 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2144 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC110926 AY163769 BC008820 CH471103 M31899 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA52396 AAH08820 AAN46739 AAY15069 EAW95312 EAW95313 EAW95314 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 2071 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||