Homo sapiens Gene: ZBTB16 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-72004.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | ZBTB16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | zinc finger and BTB domain containing 16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | PLZF; ZNF145 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000109906 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
zinc finger and BTB domain containing 16
zinc finger and BTB domain containing 16
zinc finger and BTB domain containing 16
zinc finger and BTB domain containing 16
zinc finger and BTB domain containing 16
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
MIR146A upregulation by CXCR4 antagonist AMD3100 treatment or ZBTB16 silencing, decreases CXCR4 protein expression and prevents HIV-1 infection of leukemic monocytic cell line and CD4(+) T lymphocytes.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the Krueppel C2H2-type zinc-finger protein family and encodes a zinc finger transcription factor that contains nine Kruppel-type zinc finger domains at the carboxyl terminus. This protein is located in the nucleus, is involved in cell cycle progression, and interacts with a histone deacetylase. Specific instances of aberrant gene rearrangement at this locus have been associated with acute promyelocytic leukemia (APL). Alternate transcriptional splice variants have been characterized. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:114059593-114250676 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 161 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 13 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Antigen processing: Ubiquitination & Proteasome degradation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
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KEGG |
Acute myeloid leukemia pathway
Pathways in cancer pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q05516 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A0A024R3C6 F5H5Y7 F5H6C3 Q71UL5 Q71UL6 Q71UL7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.591945 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001018011 NM_006006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12930 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 176797 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8367 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 11762 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AF060568 AF076613 AF076615 AF076616 AP000908 AP002518 AP002755 BC026902 BC029812 CH471065 S60093 Z19002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAC32847 AAC32848 AAC32849 AAC60590 AAD03619 AAH26902 AAH29812 CAA79489 EAW67241 EAW67242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7704 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||