Homo sapiens Gene: APOA5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-72432.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | APOA5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | apolipoprotein A-V | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000110243 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
apolipoprotein A-V
apolipoprotein A-V
apolipoprotein A-V
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is an apolipoprotein that plays an important role in regulating the plasma triglyceride levels, a major risk factor for coronary artery disease. It is a component of high density lipoprotein and is highly similar to a rat protein that is upregulated in response to liver injury. Mutations in this gene have been associated with hypertriglyceridemia and hyperlipoproteinemia type 5. This gene is located proximal to the apolipoprotein gene cluster on chromosome 11q23. Alternatively spliced transcript variants encoding the same protein have been identified. [provided by RefSeq, Oct 2009] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:116789367-116792420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 5 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
PPARA activates gene expression pathway
Regulation of lipid metabolism by Peroxisome proliferator-activated receptor alpha (PPARalpha) pathway
Chylomicron-mediated lipid transport pathway
Fatty acid, triacylglycerol, and ketone body metabolism pathway
Metabolism of lipids and lipoproteins pathway
Lipoprotein metabolism pathway
Metabolism pathway
Lipid digestion, mobilization, and transport pathway
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KEGG |
PPAR signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JZZ0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 116519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.283923 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001166598 NM_052968 XM_006718761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:17288 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 606368 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS8376 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 06966 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AP006216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 116519 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||