Homo sapiens Gene: RBAK | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-7390.7 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | RBAK | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | RB-associated KRAB zinc finger | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000146587 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
RB-associated KRAB zinc finger
RB-associated KRAB zinc finger
RB-associated KRAB zinc finger
RB-associated KRAB zinc finger
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This locus represents naturally occurring read-through transcription between the neighboring RBAK (RB-associated KRAB zinc finger) and LOC389458 (hypothetical LOC389458) genes on chromosome 7. The read-through transcript encodes a protein that shares sequence identity with the upstream gene product but its C-terminal region is distinct due to frameshifts relative to the downstream gene. [provided by RefSeq, Mar 2011] This gene encodes a nuclear protein which interacts with the tumor suppressor retinoblastoma 1. The two interacting proteins are thought to act as a transcriptional repressor for promoters which are activated by the E2F1 transcription factor. This protein contains a Kruppel-associated box (KRAB), which is a transcriptional repressor motif. Read-through transcripts that include exons from the downstream gene LOC389458 are expressed from this locus. [provided by RefSeq, Mar 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 7:5045821-5069488 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p22.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 6 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.396178 Hs.733005 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001204513 NM_001204456 NM_021163 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS56463 CCDS5337 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||