Homo sapiens Gene: PCDH15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-74763.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PCDH15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | protocadherin-related 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000150275 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
protocadherin-related 15
protocadherin-related 15
protocadherin-related 15
protocadherin-related 15
protocadherin-related 15
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protocadherin-related 15
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene is a member of the cadherin superfamily. Family members encode integral membrane proteins that mediate calcium-dependent cell-cell adhesion. It plays an essential role in maintenance of normal retinal and cochlear function. Mutations in this gene result in hearing loss and Usher Syndrome Type IF (USH1F). Extensive alternative splicing resulting in multiple isoforms has been observed in the mouse ortholog. Similar alternatively spliced transcripts are inferred to occur in human, and additional variants are likely to occur. [provided by RefSeq, Dec 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:53802771-55627942 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q21.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 3 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A2A3D9 E7EM97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 65217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.280209 Hs.554391 Hs.627680 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001142763 NM_001142764 NM_001142765 NM_001142766 NM_001142767 NM_001142768 NM_001142769 NM_001142770 NM_001142771 NM_001142772 NM_001142773 NM_033056 XM_006717950 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:14674 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 605514 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS44400 CCDS44401 CCDS44403 CCDS44404 CCDS7248 CCDS73134 CCDS73135 CCDS73136 CCDS73137 CCDS73138 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05698 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC013737 AC016817 AC016822 AC024073 AC027671 AC051618 AC069545 AC074322 AC079271 AL353784 AL355314 AL356114 AL360214 AL365496 AL390785 AL391356 AL603835 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 65217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||