Version 5.4
| Homo sapiens Gene: VPS26A | |||||||||||||||||||||||
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| Summary | |||||||||||||||||||||||
| InnateDB Gene | IDBG-76507.6 | ||||||||||||||||||||||
| Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
| Gene Symbol | VPS26A | ||||||||||||||||||||||
| Gene Name | vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe) | ||||||||||||||||||||||
| Synonyms | HB58; Hbeta58; PEP8A; VPS26 | ||||||||||||||||||||||
| Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
| Ensembl Gene | ENSG00000122958 | ||||||||||||||||||||||
| Encoded Proteins |
vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe)
vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe)
vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe)
vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe)
vacuolar protein sorting 26 homolog A (S. pombe)
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| Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
| Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| Summary |
This gene belongs to a group of vacuolar protein sorting (VPS) genes. The encoded protein is a component of a large multimeric complex, termed the retromer complex, involved in retrograde transport of proteins from endosomes to the trans-Golgi network. The close structural similarity between the yeast and human proteins that make up this complex suggests a similarity in function. Expression studies in yeast and mammalian cells indicate that this protein interacts directly with VPS35, which serves as the core of the retromer complex. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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| Gene Information | |||||||||||||||||||||||
| Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
| Genomic Location | Chromosome 10:69123512-69172861 | ||||||||||||||||||||||
| Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||
| Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||
| Transcripts | |||||||||||||||||||||||
| Interactions | |||||||||||||||||||||||
| Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 65 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 1 interaction(s) predicted by orthology.
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| Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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| Biological Process |
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| Cellular Component |
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| Orthologs | |||||||||||||||||||||||
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Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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| Pathways | |||||||||||||||||||||||
| NETPATH | |||||||||||||||||||||||
| REACTOME |
Signaling by WNT in cancer pathway
Signaling by Wnt pathway
WNT ligand secretion is abrogated by the PORCN inhibitor LGK974 pathway
Signal Transduction pathway
WNT ligand biogenesis and trafficking pathway
Disease pathway
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| KEGG | |||||||||||||||||||||||
| INOH | |||||||||||||||||||||||
| PID NCI | |||||||||||||||||||||||
| Cross-References | |||||||||||||||||||||||
| SwissProt | |||||||||||||||||||||||
| TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
| UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
| Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
| UniGene | Hs.596589 Hs.680139 | ||||||||||||||||||||||
| RefSeq | NM_001035260 NM_004896 | ||||||||||||||||||||||
| HUGO | |||||||||||||||||||||||
| OMIM | |||||||||||||||||||||||
| CCDS | CCDS41536 CCDS7286 | ||||||||||||||||||||||
| HPRD | 08385 | ||||||||||||||||||||||
| IMGT | |||||||||||||||||||||||
| EMBL | |||||||||||||||||||||||
| GenPept | |||||||||||||||||||||||
| RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||