Homo sapiens Gene: PRF1 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-77451.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRF1 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | perforin 1 (pore forming protein) | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | FLH2; HPLH2; P1; PFN1; PFP | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000180644 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
perforin 1 (pore forming protein)
perforin 1 (pore forming protein)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene has structural and functional similarities to complement component 9 (C9). Like C9, this protein creates transmembrane tubules and is capable of lysing non-specifically a variety of target cells. This protein is one of the main cytolytic proteins of cytolytic granules, and it is known to be a key effector molecule for T-cell- and natural killer-cell-mediated cytolysis. Defects in this gene cause familial hemophagocytic lymphohistiocytosis type 2 (HPLH2), a rare and lethal autosomal recessive disorder of early childhood. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding the same protein. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:70597348-70602775 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | q22.1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 5 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG |
Type I diabetes mellitus pathway
Natural killer cell mediated cytotoxicity pathway
Allograft rejection pathway
Autoimmune thyroid disease pathway
Graft-versus-host disease pathway
Viral myocarditis pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
TCR signaling in naïve CD8+ T cells
Caspase Cascade in Apoptosis
Downstream signaling in naïve CD8+ T cells
IL12 signaling mediated by STAT4
IL2 signaling events mediated by STAT5
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.2200 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001083116 NM_005041 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS7305 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 01362 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||