Homo sapiens Gene: CTSL2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-77609.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | CTSL2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | cathepsin L2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CATL2; CTSL2; CTSU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000136943 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
cathepsin L2
cathepsin L2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene, a member of the peptidase C1 family, is a lysosomal cysteine proteinase that may play an important role in corneal physiology. This gene is expressed in colorectal and breast carcinomas but not in normal colon, mammary gland, or peritumoral tissues, suggesting a possible role for this gene in tumor processes. Alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Jan 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:97029679-97039643 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q22.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 2 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Endosomal/Vacuolar pathway pathway
Trafficking and processing of endosomal TLR pathway
MHC class II antigen presentation pathway
Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures pathway
Activation of Matrix Metalloproteinases pathway
Extracellular matrix organization pathway
Innate Immune System pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Antigen processing-Cross presentation pathway
Adaptive Immune System pathway
Immune System pathway
Class I MHC mediated antigen processing & presentation pathway
Collagen formation pathway
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KEGG |
Lysosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.610096 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001201575 NM_001333 XM_006716960 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6723 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 04495 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||