Homo sapiens Gene: FN1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-80237.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | FN1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | fibronectin 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CIG; ED-B; FINC; FN; FNZ; GFND; GFND2; LETS; MSF | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000115414 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
fibronectin 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes fibronectin, a glycoprotein present in a soluble dimeric form in plasma, and in a dimeric or multimeric form at the cell surface and in extracellular matrix. Fibronectin is involved in cell adhesion and migration processes including embryogenesis, wound healing, blood coagulation, host defense, and metastasis. The gene has three regions subject to alternative splicing, with the potential to produce 20 different transcript variants. However, the full-length nature of some variants has not been determined. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:215360440-215436172 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 758 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Cell surface interactions at the vascular wall pathway
GRB2:SOS provides linkage to MAPK signaling for Integrins pathway
p130Cas linkage to MAPK signaling for integrins pathway
Integrin alphaIIb beta3 signaling pathway
Platelet Aggregation (Plug Formation) pathway
Platelet degranulation pathway
Response to elevated platelet cytosolic Ca2+ pathway
Integrin cell surface interactions pathway
Molecules associated with elastic fibres pathway
Elastic fibre formation pathway
Fibronectin matrix formation pathway
Extracellular matrix organization pathway
Degradation of the extracellular matrix pathway
Syndecan interactions pathway
Platelet activation, signaling and aggregation pathway
Signal Transduction pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
Hemostasis pathway
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KEGG |
Regulation of actin cytoskeleton pathway
ECM-receptor interaction pathway
Small cell lung cancer pathway
Focal adhesion pathway
Pathways in cancer pathway
Amoebiasis pathway
Bacterial invasion of epithelial cells pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Syndecan-2-mediated signaling events
Beta1 integrin cell surface interactions
Integrins in angiogenesis
VEGFR3 signaling in lymphatic endothelium
Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling
Alpha9 beta1 integrin signaling events
Angiopoietin receptor Tie2-mediated signaling
Syndecan-4-mediated signaling events
Alpha4 beta1 integrin signaling events
Beta3 integrin cell surface interactions
Beta5 beta6 beta7 and beta8 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P02751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | A6YID6 Q53S27 Q7L553 Q9H382 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 2335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.203717 Hs.626165 Hs.629065 Hs.660195 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_212482 XM_005246397 NM_002026 NM_054034 NM_212474 NM_212476 NM_212478 XM_005246399 XM_005246400 XM_005246404 XM_005246406 XM_005246411 XM_005246413 XM_005246415 XM_005246416 XM_005246417 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:3778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 135600 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS42814 CCDS2399 CCDS2400 CCDS42813 CCDS46510 CCDS46512 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00626 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AB191261 AB209840 AC012462 AC073284 AF130095 AF312399 AJ276395 AJ320525 AJ320526 AJ320527 AJ535086 AJ849445 AL832202 BC005858 BC117176 BC143763 BT006856 BX537590 BX538017 BX538018 BX538045 BX640608 BX640731 BX640875 BX640920 CH471063 CR749281 CR749316 CR749317 EF550134 M10905 M12549 M14059 M15801 M18177 M18178 M18179 M27589 U41850 U42404 U42455 U42456 U42457 U42458 U42592 U42593 U42594 X02761 X04530 X07717 X07718 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA52461 AAA52462 AAA52463 AAA52465 AAA53376 AAA58483 AAD00014 AAD00015 AAD00017 AAD00018 AAD00019 AAD04751 AAD09448 AAD09449 AAD09450 AAG30571 AAG35520 AAH05858 AAI17177 AAI43764 AAP35502 AAX76513 AAY24063 ABR68538 BAD52437 BAD93077 CAA26536 CAB52436 CAB52437 CAC20427 CAC86914 CAC86915 CAC86916 CAD59389 CAD91166 CAD97791 CAD97964 CAD97965 CAD97984 CAE45714 CAE45847 CAE45932 CAE45958 CAH18136 CAH18171 CAH18172 CAH60958 EAW70536 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 2335 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||