Homo sapiens Gene: XRCC5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-80616.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | XRCC5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | KARP-1; KARP1; KU80; Ku86; KUB2; NFIV | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000079246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
Vaccinia virus protein C16 influences the immune response by binding to the XRCC6/XRCC5 (Ku70/80) complex thus blocking PRKDC-dependent DNA sensing in fibroblasts
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is the 80-kilodalton subunit of the Ku heterodimer protein which is also known as ATP-dependant DNA helicase II or DNA repair protein XRCC5. Ku is the DNA-binding component of the DNA-dependent protein kinase, and it functions together with the DNA ligase IV-XRCC4 complex in the repair of DNA double-strand break by non-homologous end joining and the completion of V(D)J recombination events. This gene functionally complements Chinese hamster xrs-6, a mutant defective in DNA double-strand break repair and in ability to undergo V(D)J recombination. A rare microsatellite polymorphism in this gene is associated with cancer in patients of varying radiosensitivity. [provided by RefSeq, Jul 2008] The protein encoded by this gene is the 80-kilodalton subunit of the Ku heterodimer protein which is also known as ATP-dependant DNA helicase II or DNA repair protein XRCC5. Ku is the DNA-binding component of the DNA-dependent protein kinase, and it functions together with the DNA ligase IV-XRCC4 complex in the repair of DNA double-strand break by non-homologous end joining and the completion of V(D)J recombination events. This gene functionally complements Chinese hamster xrs-6, a mutant defective in DNA double-strand break repair and in ability to undergo V(D)J recombination. A rare microsatellite polymorphism in this gene is associated with cancer in patients of varying radiosensitivity. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:216107464-216206303 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 241 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 7 interaction(s) predicted by orthology.
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological Process |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular Component |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
|
Gene ID
Gene Order
Not yet available
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
STING mediated induction of host immune responses pathway
2-LTR circle formation pathway
Integration of provirus pathway
Early Phase of HIV Life Cycle pathway
Processing of DNA ends prior to end rejoining pathway
Nonhomologous End-joining (NHEJ) pathway
IRF3-mediated induction of type I IFN pathway
Innate Immune System pathway
Double-Strand Break Repair pathway
Immune System pathway
HIV Life Cycle pathway
HIV Infection pathway
Cytosolic sensors of pathogen-associated DNA pathway
Disease pathway
DNA Repair pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Non-homologous end-joining pathway
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Coregulation of Androgen receptor activity
BARD1 signaling events
DNA-PK pathway in nonhomologous end joining
Regulation of Telomerase
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P13010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JZ81 Q53T09 Q53TC2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 7520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.597412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_021141 XM_005246836 XM_005246837 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:12833 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 194364 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 08935 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC010686 AC012513 AK222603 AK290740 BC019027 BC095442 CH471063 DQ787434 J04977 M30938 X57500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA36154 AAA59475 AAH19027 AAH95442 AAY14659 AAY24231 ABG46942 BAD96323 BAF83429 CAA40736 EAW70562 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 7520 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||