Homo sapiens Gene: SNAI1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-80676.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SNAI1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | snail homolog 1 (Drosophila) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | dJ710H13.1; SLUGH2; SNA; SNAH; SNAIL; SNAIL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000124216 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
snail homolog 1 (Drosophila)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
The Drosophila embryonic protein snail is a zinc finger transcriptional repressor which downregulates the expression of ectodermal genes within the mesoderm. The nuclear protein encoded by this gene is structurally similar to the Drosophila snail protein, and is also thought to be critical for mesoderm formation in the developing embryo. At least two variants of a similar processed pseudogene have been found on chromosome 2. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 20:49982999-49988886 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q13.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 63 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 4 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
KEGG |
Adherens junction pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Signaling events mediated by Hepatocyte Growth Factor Receptor (c-Met)
Validated targets of C-MYC transcriptional activation
Integrin-linked kinase signaling
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.48029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_005985 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS13423 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 05025 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||