Homo sapiens Gene: PRPF4 | |||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-81603.6 | ||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||
Gene Symbol | PRPF4 | ||||||||||||||||||
Gene Name | PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast) | ||||||||||||||||||
Synonyms | HPRP4; HPRP4P; PRP4; Prp4p; RP70; SNRNP60 | ||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000136875 | ||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast)
PRP4 pre-mRNA processing factor 4 homolog (yeast)
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Protein Structure | |||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene is part of a heteromeric complex that binds U4, U5, and U6 small nuclear RNAs and is involved in pre-mRNA splicing. The encoded protein also is a mitotic checkpoint protein and a regulator of chemoresistance in human ovarian cancer. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Oct 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:113275343-113292905 | ||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||
Band | q32 | ||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 85 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||
UniGene | Hs.374973 Hs.741686 | ||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001244926 NM_004697 | ||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||
CCDS | CCDS59142 CCDS6791 | ||||||||||||||||||
HPRD | 08479 | ||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||