Homo sapiens Gene: IFIT1 | |||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-81960.6 | ||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | IFIT1 | ||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1 | ||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | C56; G10P1; IFI-56; IFI-56K; IFI56; IFIT-1; IFNAI1; ISG56; P56; RNM561 | ||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000185745 | ||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1
interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
IFIT1 expression activates the IFN response during C. pneumoniae infection, mediated by intracellular nucleotide-sensing pattern recognition receptors (PRRs), which operate through a mechanism dependent on the bacterial type III secretion system (T3SS).
IFIT1 recognizes and directly binds to 5'-triphosphate RNA and functions as an innate inhibitor of viral replication and pathogenicity. (Demonstrated in murine model)
IFIT1 is an innate immune network bottleneck with the ability to suppress induction of TLR4 response genes in LPS-stimulated macrophages. (Demonstrated in mice)
IFIT1 binds mRNAs that lack 2â?²O methylation on the first ribose, thus inhibiting translation by impairing binding of eukaryotic translation initiation factors to 2â?²O-unmethylated RNA templates
IFIT1 binds with high affinity to the cap-proximal regions of cap0-mRNAs abrogating 48S complex formation in an in vitro reconstituted translation system.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a protein containing tetratricopeptide repeats that was originally identified as induced upon treatment with interferon. The encoded protein may inhibit viral replication and translational initiation. This gene is located in a cluster on chromosome 10 with five other closely related genes. There is a pseudogene for this gene on chromosome 13. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed. [provided by RefSeq, Aug 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 10:89392546-89406486 | ||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||
Band | q23.31 | ||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 58 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon alpha/beta signaling pathway
ISG15 antiviral mechanism pathway
Antiviral mechanism by IFN-stimulated genes pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG |
Hepatitis C pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.20315 | ||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001270927 NM_001270928 NM_001270929 NM_001270930 NM_001548 | ||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS31243 CCDS59220 | ||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 00983 | ||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||