Homo sapiens Gene: TNC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82348.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | TNC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | tenascin C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | 150-225; DFNA56; GMEM; GP; HXB; JI; TN; TN-C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000041982 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
tenascin C
tenascin C
tenascin C
tenascin C
tenascin C
tenascin C
tenascin C
tenascin C
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes an extracellular matrix protein with a spatially and temporally restricted tissue distribution. This protein is homohexameric with disulfide-linked subunits, and contains multiple EGF-like and fibronectin type-III domains. It is implicated in guidance of migrating neurons as well as axons during development, synaptic plasticity, and neuronal regeneration. [provided by RefSeq, Jul 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 9:115019578-115118257 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q33.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 9 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Integrin cell surface interactions pathway
Extracellular matrix organization pathway
Syndecan interactions pathway
ECM proteoglycans pathway
Non-integrin membrane-ECM interactions pathway
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KEGG |
ECM-receptor interaction pathway
Focal adhesion pathway
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INOH |
Integrin signaling pathway pathway
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PID NCI |
Beta1 integrin cell surface interactions
Alpha9 beta1 integrin signaling events
Syndecan-4-mediated signaling events
Beta3 integrin cell surface interactions
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.143250 Hs.684865 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_002160 XM_005251975 XM_006717098 XM_006717100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS6811 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | 01756 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||