Homo sapiens Gene: SP100 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-82951.6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SP100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | SP100 nuclear antigen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | lysp100b | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000067066 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
SP100 nuclear antigen
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene encodes a subnuclear organelle and major component of the PML (promyelocytic leukemia)-SP100 nuclear bodies. PML and SP100 are covalently modified by the SUMO-1 modifier, which is considered crucial to nuclear body interactions. The encoded protein binds heterochromatin proteins and is thought to play a role in tumorigenesis, immunity, and gene regulation. Alternatively spliced variants have been identified for this gene; one of which encodes a high-mobility group protein. [provided by RefSeq, Aug 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 2:230415942-230544090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | q37.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 56 experimentally validated interaction(s) in this database.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
No orthologs found for this gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
Interferon gamma signaling pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Interferon Signaling pathway
Immune System pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | P23497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | C9JBL0 E9PHV6 H7C4B4 Q4ZG64 Q53TD0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 6672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.369056 Hs.603387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001080391 NM_001206701 NM_001206702 NM_001206703 NM_001206704 NM_003113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | HGNC:11206 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | 604585 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS2477 CCDS42832 CCDS56170 CCDS56171 CCDS56172 CCDS56173 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AC009949 AC010149 AF056322 AF076675 AF255565 AF378670 AK293373 BC011562 L79986 L79987 L79988 M60618 U36501 X95472 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAA35537 AAC39790 AAC50743 AAF39781 AAH11562 AAK51202 AAK57703 AAL77438 AAL77439 AAL77441 AAX88870 AAY14879 BAG56886 CAA64744 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 6672 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||