Homo sapiens Gene: SPDEF | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-83610.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | SPDEF | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | SAM pointed domain containing ets transcription factor | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | bA375E1.3; PDEF | ||||||||||||||||||||||
Species | Homo sapiens | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSG00000124664 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
SAM pointed domain containing ets transcription factor
SAM pointed domain containing ets transcription factor
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
The protein encoded by this gene belongs to the ETS family of transcription factors. It is highly expressed in the prostate epithelial cells, and functions as an androgen-independent transactivator of prostate-specific antigen (PSA) promoter. Higher expression of this protein has also been reported in brain, breast, lung and ovarian tumors, compared to the corresponding normal tissues, and it shows better tumor-association than other cancer-associated molecules, making it a more suitable target for developing specific cancer therapies. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 6:34537802-34556333 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | p21.31 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 7 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 2 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Mus musculus
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH |
AndrogenReceptor pathway
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REACTOME | |||||||||||||||||||||||
KEGG | |||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Regulation of Androgen receptor activity
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | Hs.485158 | ||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001252294 NM_012391 XM_005248988 XM_006715048 | ||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS4794 CCDS59013 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | 12176 | ||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||